Fondée en 1985, la SFAM a mis rapidement en œuvre deux chantiers importants : la revue Analyse musicale, dont le premier numéro a paru en novembre 1985, et le Premier Congrès européen d’Analyse musicale, qui a eu lieu en 1989 à Colmar avec 300 participants et une trentaine de pays représentés.
Ce premier Congrès a servi de modèle à ce qu’on a appelé depuis les EuroMAC, les European Music Analysis Conferences : Trento (Italie) en 1991, Montpellier (France) en 1995, Rotterdam (Pays-Bas) en 1999, Bristol (Royaume-Uni) en 2002, Freiburg (Allemagne) en 2007, Rome (Italie) en 2011, Leuven (Belgique) en 2014, Strasbourg (France) en 2017, Moscou (Russie) en 2021.
Trente-deux numéros de la revue Analyse Musicale ont été publiés « sous l’égide » de la Sfam, de 1985 à 1993. Cette revue a continué ensuite jusqu’en 2016 sans lien avec la SFAM. Elle n’est plus disponible aujourd’hui.
La SFAM a ensuite créé en 1994 une nouvelle revue, Musurgia (Éditions Eska), qui propose quatre numéros annuels. Les rédacteurs en chef ont été André Riotte (1994-2000) et Nicolas Meeùs (2001-2016). La rédaction en chef est assurée depuis 2017 par Muriel Boulan, Christophe Guillotel-Nothmann et Nathalie Hérold. Cette revue doit être commandée directement aux Éditions Eska.
La revue Musimédiane (exclusivement en ligne) a été créée en 2005, notamment pour faire usage de médias électroniques, audio et vidéo.
La SFAM soutient par ailleurs de nombreuses publications d’ouvrages. Elle a organisé de nombreux colloques et séminaires. Depuis 2013, elle organise annuellement des Journées d’Analyse Musicale.